II. interní klinika je centrem, kde je řešeno několik grantů a výzkumných záměrů, které jsou řešeny i ve spolupráci s jinými pracovišti v České republice a na mezinárodní úrovni. Spolupráce byla realizována mimo jiné s University of Iowa, University of Cambridge.

Pracovníci kliniky se tradičně podílejí na celé řadě publikací. Jednak časopiseckých, ale i na tvorbě učebních textů a monografií.